酰基辅酶A（Acyl-CoA）是一个参与脂肪酸代谢的辅酶家族，是当CoA附着在活细胞中长链脂肪酸末端时形成的临时化合物。酰基辅酶A经历β氧化形成至少一个乙酰辅酶A分子，乙酰辅酶A进入柠檬酸循环最终形成ATP分子。

当对能量的需求增加时，如疾病、禁食和肌肉锻炼，线粒体中脂肪酸的氧化会产生供利用的能量。脂肪酸氧化（FAO）的生物学过程包括肉碱循环、β氧化循环、电子传递链，以及在肝脏中的酮合成。游离脂肪酸在线粒体膜外的胞质溶胶中被激活为辅酶A酯。长链（C16和C18）脂肪酰基辅酶A以酰基肉碱的形式进入线粒体，并在线粒体膜上转换为对应的酰基辅酶A。

在脂肪酸氧化的过程中，脂肪酰基辅酶A链被缩短两个碳原子，直到完全转化为乙酰辅酶A。β氧化过程中释放的能量转移到电子传递链，以生成三磷酸腺苷（ATP）。在肝脏中，大多数乙酰辅酶A都用于合成酮体（3-羟基丁酸酯和乙酰乙酸酯），这些酮体可以被无法氧化脂肪酸的组织（尤其是大脑）用作燃料。脂肪酸可以直接被心脏和骨骼肌等组织用作能量来源。脂肪酸氧化的疾病可能导致各种表型，包括脑损伤、低血糖、肾功能不全、肝病以及心脏和骨骼肌损伤。

尽早发现脂肪酸的氧化的对于疾病早期评估和预防很重要。脂肪酸氧化缺陷中主要累积的代谢物是线粒体内的酰基辅酶A。通常，可以通过测量次级代谢产物（如酰基肉碱、酰基甘氨酸和二羧酸）来研究这些缺陷。大多数分享方法都包括HPLC分离，由于长链、中链和短链酰基辅酶A之间的疏水性差异，完整的酰基辅酶A检测难以实现。Andrew A.Palladino通过使用流动注射串联质谱仪实现所有链长的不同脂肪酰基辅酶A的直接测量，该方法通过对短链酰基辅酶A脱氢酶缺陷小鼠的肝脏，敲除中链和短链3-羟酰基辅酶A脱氢酶基因的小鼠进行了评估和测试。

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1. Palmitoyl-CoA
2. Palmitoleoyl-CoA
3. Stearoyl-CoA
4. Oleoyl-CoA
5. Linoleoyl-CoA
6. Arachidyl-CoA
7. Arachidonyl-CoA
8. Behenyl-CoA
9. Lignoceryl-CoA (Tetracosahexaenoyl)
10. Cerotyl-CoA

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