百泰派克生物结合MALDI-TOF质谱系统与LC-MS/MS质谱系统，提供专业准确的蛋白胶点、胶条、IP样品蛋白鉴定服务。可鉴定的样品包括：1D-SDS PAGE分离的蛋白胶条，2DE PAGE中的蛋白胶点，蛋白表达产物，免疫共沉淀（Co-IP）样品。其中，蛋白质样品的鉴定前处理过程严格按照Nature Methods发表的文章：Universal sample preparation method for proteome analysis进行，保证鉴定试验中得到更高的肽段覆盖率。质谱鉴定的原理则是基于鸟枪法（Shot-gun）：将蛋白条带或者蛋白溶液酶切成肽段混合物，经高效液相色谱分离得到若干较为简单的组分，进入高分辨率质谱仪中进行分析。检索软件根据二级质谱信息与相应的数据库比对，结合匹配度打分及错配过滤，可得到肽段的确切序列，进而拼接出各蛋白的完整序列，从而实现对蛋白的鉴定。

蛋白质质谱鉴定流程

基于鸟枪法（shot-gun）LC-MS的蛋白鉴定流程

关于样品

1D SDS PAGE /2D PAGE gels样品： 
1. Coomassie Blue, SYPRO Ruby 以及Silver stain样品均可进行蛋白的鉴定试验；
2. 银染的样品有可能与后续的质谱分析不兼容，我们推荐您使用下面的产品或者实验步骤进行银染实验：
ProteoSilver Plus, Sigma (Product # PROTSIL1 or PROTSIL2)
Dodeca Silver Stain, BioRad (Product # 161-0481 or 161-0480)
3. 银染的样品请不要进行脱色处理 

液体样品（In solution format）： 
1. 假如样品中蛋白量＞10ug，我们对样品的缓冲体系没有要求；
2. 假如样品中蛋白量＜10ug，样品准备过程中尽量减少SDS等表面活性剂的使用，并注意降低盐浓度；
3. 提交样品过程中，注意提供样品的缓冲体系和样品中蛋白的预估含量； 

Co-IP样品： 
1. 如果您洗脱的样品需要跑胶，请按照1D SDS PAGE样品准备要求准备样品即可；
2. 如果您直接提交洗脱样品，我们推荐使用HPH EB (0.5 M NH4OH, 0.5 mM EDTA) 缓冲体系进行最后一步蛋白的洗脱，保证洗脱缓冲体系与后续的质谱实验兼容； 

样品运输：
1. 我们推荐您将样品冻干后进行运输，冻干样品中蛋白非常稳定。
2. 液体样品推荐干冰运输，短途运输冰袋也可以。 

注意事项： 利用质谱进行蛋白样品的鉴定，在样品准备过程中需佩戴手套和头套，尽量避免自身角蛋白（keratin）对样品的污染。

研究案例

该项目是中国科学院生物物理所一位老师将她的Co-IP的样品寄给我们进行蛋白鉴定。得到的部分结果如下图所示：

蛋白胶点、胶条、IP样品蛋白鉴定研究案例

从图中客户看出，我们提供的最终结果中包含鉴定到的蛋白的Accession Number, Peptide coverage, 鉴定出的肽段信息，鉴定出的肽段的修饰信息以及对鉴定到的蛋白的详细描述。

中/英文项目报告：

在最终的技术报告中，百泰派克会为您提供详细的中英文双语版技术报告，报告包括：

1. 实验步骤（中英文）
2. 相关的质谱参数（中英文）
3. 质谱图片 
4. 原始数据
5. 鉴定的蛋白质详细信息

蛋白胶点、胶条、IP样品质谱鉴定一站式服务

您只需下单-寄送样品 
百泰派克一站式服务完成：样品处理-上机分析-数据分析-项目报告

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